El fenómeno de la migración ha impactado fuertemente a la sociedad salvadoreña, incluyendo a las iglesias evangélicas. El pastor Mario Vega comenta que no es competencia de la iglesia acabar con las causas de la migración, pero sí tiene la tarea de humanizar a los afectados, cristianizar la situación de los desplazados y asistir a los necesitados.