El Centro de Protagonismo Infantil es un seminario que dura 6 meses. Cada niño y niña entre los 10 y 15 años recibe un empoderamiento sobre sus derechos y deberes, además de permitirle desarrollarse de una mejor manera y abrir las puertas para iniciar colaborando en las diferentes áreas de Iglesia Infantil ELIM. Trabajo que demuestra también el interés que Misión Cristiana Elim tiene en pro de la niñez.